臨床治療兒科風溼性心臟病時，主要是使用抗生素類、抗凝藥物以及改善心肌重構的藥物進行治療。另外，在發病期間還需要注意生活護理。
抗生素類
盤尼西林
如果患兒是A組β型溶血性鏈球菌感染導致的風溼性心臟病，則首選盤尼西林進行治療，可以抑制細菌細胞壁合成而發揮殺菌作用，從而控制感染症狀。
2.阿莫西林（Amoxicillin）：若對盤尼西林過敏或不耐受，則可遵醫囑改用阿莫西林（Amoxicillin），該藥屬於廣譜抗菌素，對於肺炎鏈球菌、金黃色葡萄球菌等致病菌引起的上呼吸道和下呼吸道感染也有較好的療效。
3.頭孢曲松(Ceftriaxone)：如果是C組鏈球菌感染所致的心臟疾病，也可在醫生指導下選擇頭孢曲松(Ceftriaxone)進行治療，其具有較強的抗菌活性，可用於敏感菌株的靜止期和活動期感染的治療。
4.雷巴威林(Ribavirin)：若是支原體、衣原體感染引起的心臟疾病，還可遵醫囑應用利巴韋林(Ribavirin)進行治療，該藥為廣譜抗病毒藥物，能抑制多種病毒的複製，如流感病毒、腺病毒等。
抗凝藥物
患有風溼性心臟病後容易形成血栓，因此需要遵醫囑服用可化凝錠(Warfarin sodium)、低分子肝素鈣膠囊等藥物進行抗凝治療，防止血栓進一步加重。
改善心肌重構的藥物
由於風溼性心臟病會導致心臟功能下降，所以可在醫生指導下服用琥珀酸鹽美托洛爾(Metroprolol succinate)、康肯膜衣錠(Bisoprolol)等β感受器阻滯劑進行治療，此類藥物能夠減慢心率、降低心排出量，從而起到保護心室的作用。
其他藥物
當患兒出現明顯不適症狀時，還需及時遵醫囑應用緩解病症的藥物，比如胺非林錠(Aminophylline)、雙硝異山梨酯(Isosorbide Dinitrate)等，以擴張血管、改善呼吸困難等症狀。
此外，必要時還需透過手術的方式進行處理。日常生活中要注意做好保暖措施，並且避免過度勞累，以免加重病情。
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