甲溝炎是因細菌感染所致的指甲及周圍軟組織的化膿性感染，若甲溝炎出現流膿的情況，則需要使用雙氧水、優點等進行區域性沖洗或擦拭。若症狀較嚴重時，則需遵醫囑口服藥物治療，並在醫生指導下外塗藥膏。
一、區域性用藥
雙氧水
屬於強氧化劑，具有一定的殺菌作用，在臨床上主要用於傷口和皮膚黏膜的消毒，可使菌體蛋白質發生變性，從而起到抑制細菌生長的作用。但不建議患者自行配比溶液，應由醫務人員配置好後使用，以免濃度過高而灼傷皮膚。
優點
是一種廣譜殺菌劑，對多種革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌以及真菌均有一定的抗菌作用，且刺激性較小，因此可用於手術部位及其他有創操作部位的消毒，也可用於燒傷、潰瘍、瘻管等部位的消毒處理。
二、口服藥物
若甲溝炎患者出現明顯紅腫、疼痛等症狀，甚至伴有發燒現象，則提示病情較為嚴重，此時可在醫生指導下服用希復欣敏(Cefixime)分散片、阿莫西林（Amoxicillin）等抗生素類藥物控制發炎發展。
三、外用藥物
褐黴素乳膏(Fusidic Acid Cream)
：為抗細菌藥膏，其主要成分為夫西地酸，可透過破壞細菌的細胞壁而達到滅菌的效果，常用於治療細菌引起的皮膚病，如毛囊炎、創傷合併感染、甲溝炎等。
魚石脂軟膏
本品為複合製劑，組分為魚石脂與甘油，其中魚石脂為礦物油，有輕度消炎、止痛、抑菌作用，適用於急性滲出性發炎、急性淋巴結炎、急性蜂窩織炎、急性皮下膿腫、急性外耳道炎、急性中耳炎、急性鼻竇炎、急性乳腺炎早期硬塊及化膿前及癤、癰初期。
其他
如允消無黴乳膏(Miconazole Cream)、酮康唑(Ketoconazole)等，對於甲溝炎也有一定療效。
四、其他治療
若甲溝炎患者的患處形成膿腫，則需及時切開引流，將膿液排出後保持區域性清潔乾燥，定期換藥促進癒合。此外，若甲溝炎反覆發作，也可透過手術拔除部分或全層趾(指)甲的方法進行治療。
日常生活中要注意個人衛生，避免經常接觸水、汙染物，以防加重病情。另外飲食上也要注意清淡，多吃新鮮水果蔬菜，補充維生素，禁食辛辣刺激性食物，戒菸酒等。
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