臨床上治療甲溝炎的藥物較多，主要包括外用藥和口服藥。如果想要較快地緩解症狀、促進恢復，需要根據甲溝炎的不同階段進行選擇。甲溝炎是指(趾)甲周圍軟組織的化膿性感染，臨床表現為患處紅腫、疼痛，隨著病情進展可出現發燒等全身症狀。
一、外用藥
消毒液
對於早期尚未完全形成膿腔的甲溝炎患者，可以使用優點溶液或過錳酸鉀(KMnO4)溶液區域性溼敷，能夠起到一定的殺菌作用，有助於減輕發炎反應。
抗生素軟膏
當甲床周圍的皮膚已經發白，並伴有明顯的波動感時，提示有積膿存在，此時單純使用外用藥的效果欠佳。建議及時就醫，在醫生的操作下將指甲拔除或將膿液引流出來，再在醫生指導下應用褐黴素乳膏(Fusidic Acid Cream)、膚利舒軟膏(Mupirocin)等抗生素軟膏塗抹於患處，以預防感染。
中藥
部分中藥也有一定消炎、抗感染的作用，如魚石脂軟膏、如意金黃散等，也可遵醫囑將其研磨成粉末後調製成糊狀，然後直接塗擦於患處，具有較好的療效。
其他
若為念珠菌所致的甲溝炎，還可遵醫囑使用允消無黴乳膏(Miconazole Cream)、黴克頓乳膏(Clotrimazole)等抗真菌類藥物進行治療。
二、口服藥
常用的口服抗菌藥物包括盤尼西林類、頭孢類以及大環內酯類抗生素，如阿莫西林（Amoxicillin）、頭孢呋辛(Cefuroxime)、克拉黴素(Clarithromycin)等。但由於甲溝炎常與致病微生物引起的反覆感染有關，因此通常不主張採用長期口服的方式來進行治療。但如果患者的病情較重，甚至出現了發燒等症狀，則可在醫生指導下適當延長療程或加大藥量。
此外，如果甲溝炎的症狀比較嚴重，經上述方式處理效果不佳，還需要考慮透過手術的方法進行治療，如沿甲溝旁縱行切開引流術等。日常生活中要注意做好個人護理工作，保持區域性清潔、乾燥，避免沾水而誘發感染的情況。
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