治療甲溝炎的藥膏較多，並不限於甲溝炎消腫專用藥膏。對於早期輕度的甲溝炎患者，可以在醫生指導下使用如意金黃散、魚石脂軟膏等外用塗抹，具有一定的抗感染作用。若病情較重，則需及時就醫，在醫生指導下選擇其他藥物進行治療。
一、甲溝炎消腫專用藥膏
如意金黃散
主要成分為人工麝香、薑黃、大黃、陳皮、黃柏、梔子、拳參、芒硝、甘草等成分組成，為淺黃色粉末，氣微腥，味苦。可起到清熱解毒、消腫止痛的作用，適用於改善皮膚紅、腫、熱、痛等症狀，常用於輔助治療瘡癤、痤瘡、急性乳腺炎、跌打損傷等病症。
魚石脂軟膏
由魚石脂、甘油、氧化鋅（Zinc Oxide）組成，為淡黃色或棕色軟膏，氣味芳香，有引溼性，擦後略有油膩感。可以區域性用於急慢性發炎、潰瘍以及膿皰等疾病的輔助治療，如燙傷、褥瘡、瘻管、滲出及化膿性皮膚病等。
二、非甲溝炎消腫專用藥膏
褐黴素乳膏(Fusidic Acid Cream)
：本品為單組份製劑，為白色透明半固體軟膏，主要用於革蘭氏陽性菌引起的細菌感染，如毛囊炎、創傷合併感染、癤和癰等原發性皮膚組織感染，也可用於繼發性細菌性皮膚病，如瘢痕疙瘩、牛皮癬樣丘疹及單純皰疹性皮病等。
膚利舒軟膏(Mupirocin)
：為區域性外用抗生素，對燒傷桿菌、棒狀桿菌、鏈球菌、葡萄球菌、炭疽芽孢桿菌、痤瘡丙酸桿菌有效，可用於治療革蘭陽性球菌引起皮膚感染，如毛囊炎、癤腫、蜂窩織炎、傷口感染、尋常型痤瘡等。
複合新黴素軟膏
本品為複合製劑，其組分為硫酸新黴素、醋酸曲安西龍(Triamcinolone acetonide)，輔料為液狀石蠟、凡士林等。臨床上主要用於防治各種細菌引起的皮膚感染，如接觸性皮膚炎、過敏性皮膚炎、潰瘍面的感染、痤瘡、小面積燒傷、濕疹及神經性皮膚炎等。
碘酊
常用醫用消毒防腐劑之一，將棉籤浸漬在溶液中取出，輕輕置於要消毒處，使其自然揮發，以達到殺菌目的。可用於皮膚黏膜的消毒，也可處理小手術前的手部及其他部位皮膚的消毒。
以上僅列舉了部分常見藥膏，除上述幾種外，還有龍珠軟膏、紅黴素(Erythromycin)軟膏等多種藥膏，均可治療甲溝炎。但需要注意的是，如果甲溝炎症狀加重，出現流膿等情況時，應及時前往醫院就診檢查並遵醫囑用藥或者手術治療。
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