甲溝炎患者可以使用外用藥膏進行治療，如褐黴素乳膏(Fusidic Acid Cream)、膚利舒軟膏(Mupirocin)等。如果甲溝炎症狀比較嚴重，則需要配合口服藥物進行治療，如阿莫西林（Amoxicillin）、希復欣敏(Cefixime)分散片等。
一、外用藥物
褐黴素乳膏(Fusidic Acid Cream)
：屬於抗生素類的外用軟膏，主要成分是夫西地酸，具有抗菌譜廣、殺菌力強的特點，對革蘭氏陽性菌和陰性菌均有效果。甲溝炎多數是由金黃色葡萄球菌感染所引起，在醫生指導下使用褐黴素乳膏(Fusidic Acid Cream)能夠起到一定的消炎作用。
膚利舒軟膏(Mupirocin)
：主要成分為莫匹羅星(Mupirocin)，為區域性用於抗細菌感染的皮膚用藥，對於革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌，例如痤瘡丙酸桿菌等，也具有一定抗菌活性。若甲溝炎是由細菌感染導致，可以在專業醫生指導下使用此藥物進行治療。
二、口服藥物
阿莫西林（Amoxicillin）
是一種常見的抗生素藥物，主要成分為阿莫西林，透過抑制細胞壁的合成而發揮殺菌作用。甲溝炎主要是由細菌感染所致，因此在醫生指導下服用該藥物可控制發炎反應。
希復欣敏(Cefixime)分散片
：屬於全身用抗生素，常用劑型有分散片、膠囊、顆粒等，其作用機制為抑制細菌細胞壁的合成，從而起到殺菌的作用。若是由於細菌感染引起的甲溝炎，此時可在醫生指導下使用希復欣敏(Cefixime)分散片進行治療。
其他
除上述常見藥物以外，患者還可遵醫囑選擇鉀鹽青黴素V、頭孢呋辛酯(Cefuroxime Axetil)等藥物進行治療，以上幾類藥物都具有較好的抗炎效果，可以幫助控制病情發展。
三、其他治療方法
當甲溝炎形成膿腫時，單純使用藥物可能無法達到理想療效，還需要採取手術方法進行切開引流處理，才可使疾病得到較好恢復。此外，日常生活中還要注意做好個人衛生工作，保持患處清潔，盡量避免搔抓患處，並減少衣物與患處摩擦，以免加重不適症狀。
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