如果患者在檢查時發現腰部有脂肪瘤，並且沒有產生壓迫症狀，則不需要進行特殊治療。若出現壓迫症狀或影響美觀等，可以採取雷射、手術等方式進行處理。
一般治療
對於體積較小的腰部脂肪瘤，通常不會對周圍組織造成壓迫和刺激，也不會引起臨床症狀，此時不用過度擔心，也不用進行特殊治療，定期複查彩色超音波即可。日常生活中要注意飲食清淡，避免食用高熱量的食物，如肥肉、炸雞等，同時要適當運動，有助於控制體重，防止脂肪瘤變大。
藥物治療
目前還沒有明確證據表明某種藥物能夠消除脂肪瘤，因此不建議使用藥物治療來去除腰部脂肪瘤。
物理治療
雷射
由於雷射裝置先進，波長較短，在燒灼脂肪瘤的同時，還具有止血作用，不易出血，癒合快，疼痛輕，恢復期短，可減少患者的痛苦。但部分患者可能會復發，需多次雷射治療才能徹底清除。
冷凍療法
採用零下196℃低溫的液氮區域性冷凍的方式將脂肪瘤細胞快速凍結，從而達到破壞腫瘤的目的。但是需要多次冷凍才可能使脂肪瘤完全消失，而且容易留下瘢痕，因此不適合面部及皮膚部位的脂肪瘤。
手術治療
對於較大的脂肪瘤或者懷疑為惡性脂肪瘤時，常採用外科手術的方法將其切除。手術方式包括傳統的開刀術式和內視鏡手術兩種，具體如下：
傳統開刀術式
是針對體積較大或多發性脂肪瘤最有效的治療手段之一。優點在於可以直接完整地將脂肪瘤從正常組織上剝離下來並予以切除，缺點就是創傷比較大，術後恢復時間較長。
內視鏡手術
是在腹腔鏡或者神經內鏡的幫助下，透過人體自然孔道進入體內進行操作的一種方法。其具有不開刀、傷害小、恢復快的優點，適用於多發病灶以及身體狀況較差無法耐受開放手術者。
其他
臨床上有一種較為少見的情況即脂肪母細胞瘤，是一種良性軟組織腫瘤，由成熟脂肪細胞組成，發生於任何年齡，女性居多。主要表現為皮下局限性腫塊，生長緩慢，病程較長。本病易誤診為良性的脂肪壞死，可透過病理活檢確診。治療方法以手術切除為主，預後較好。
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