臨床上並沒有治療皮下脂肪瘤的專用藥膏。對於體積較小、無臨床症狀的皮下脂肪瘤患者可不進行特殊處理，密切觀察即可。如果皮下脂肪瘤較大或出現壓迫症狀，則建議手術切除。
1.複合肝素鈉(Heparin sodium)：主要成分為水楊酸甲酯、醋酸苯酚、二乙醇胺等，具有止癢和促進血液循環的作用，在一定程度上可以緩解因脂肪瘤產生的瘙癢感，但無法去除脂肪瘤。
維生素E乳膏
含有維生素E、甘油、二氧化鈦、氧化鋅（Zinc Oxide）等成分，適用於皮膚乾燥及因季節變化所引起的皮膚瘙癢症，如脂溢性濕疹、神經性皮膚炎、接觸性皮膚炎、日光性皮炎等，使用後可在患處形成一層保護膜，減少對區域性組織刺激，起到輔助改善作用。
氟輕松軟膏
屬於類固醇，可用於過敏性疾病以及炎症性疾病，如接觸性皮膚炎、神經性皮膚炎、異位性皮炎、牛皮癬、濕疹、扁平苔蘚、單純皰疹、玫瑰糠疹等疾病。使用時需注意，大面積應用或延長用藥時間可能會引起全身反應，如痤瘡、酒糟鼻樣皮膚炎、口周圍皮膚炎、皮膚萎縮及微血管擴張，並可誘發或加重感染。
4.普特皮軟膏(Tacrolimus)：是一種免疫抑制劑，主要用於治療白癜風、斑禿、異位性皮膚炎、泛發性膿皰型銀屑病、外陰白斑、兒童慢性腎功能衰竭換移植術後抗排異反應等疾病的輔助治療。該藥有輕微刺激性，若用於治療皮下脂肪瘤，需要在醫生指導下根據病情選擇合適的療程。
其他藥膏
如牡丹酚軟膏（Paeonol）、尿素(Urea)維E乳膏、黑豆餾油軟膏等，均有助於消除皮下脂肪瘤。
當發現存在皮下脂肪瘤時，應及時就醫明確診斷並給予相應治療，避免自行盲目用藥。同時應注意飲食清淡，多吃新鮮蔬菜水果，補充維他命C、蛋白質等營養物質，忌食辛辣刺激食物，戒菸限酒，養成良好的生活習慣。
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