對於較小的鎖骨窩脂肪瘤，通常無需進行特殊處理。若出現增大或壓迫症狀，則可以採取手術切除、注射硬化劑等方法進行治療。如果無明顯不適症狀，僅在體檢時發現，此時可暫時不進行干預。
藥物治療
由於鎖骨窩脂肪瘤是良性病變，因此一般不會對身體造成不良影響，也不會引起相關症狀。但如果患者擔心腫瘤有惡變可能，或者因區域性隆起過大而產生壓迫感，可以透過口服消融類藥物來消除脂肪瘤。如常用的口服藥物為阿苯達唑(Albendazole)片，該藥屬於苯並咪唑衍生物，具有廣譜驅蟲作用，能夠干擾寄生蟲攝取葡萄糖，使體內細胞能量代謝受到障礙，同時又不能進行正常的生理功能，最終導致死亡。
物理治療
雷射治療
將特定波長的先進雷射光束照射到人體皮下組織層，透過其熱能效應，直接擊碎並祛除皮下沉著過多的脂肪細胞，從而達到快速去脂的目的。
射頻消融
利用高頻率電流產生的熱能阻斷脂肪酸的分泌，然後溶解掉多餘的脂肪，以去除腫物。
手術治療
傳統開放性手術
需要在體表作切口，完整地將腫物從正常部位上剝離下來，並且要清除周圍受累組織，最後再縫合傷口。
微創手術
目前臨床常用的是內窺鏡輔助下的微創手術，在鎖骨窩處做小切口，放入特製的內窺鏡裝置，找到脂肪瘤後將其摘除即可。
介入栓塞術
適用於與血管相關的脂肪瘤，即血液供應主要來自某一粗大血管分支的情況。醫生會經股動脈插入導管至發生脂肪瘤的血管腔內，然後注入凝血酶水解蛋白和顯影劑混合液，使其破壞血管壁並阻止繼續向瘤體內新生血管提供營養物質，進而促使瘤體萎縮消失。
脂肪抽吸術
適用於體積較大、位置深在的脂肪瘤，需使用特殊的儀器，在鎖骨窩脂肪瘤區域抽取一部分脂肪組織，然後用負壓吸引器將脂肪抽出，從而減輕患者的病情。
其他
當患者存在一定的運動需求時，也可採用超音波刀技術進行治療。此法是在皮膚表面開啟0.5cm左右的小切口，然後透過超音波刀所產生的高溫熱量，將脂肪瘤予以燒灼、破壞，從而達到去除腫物目的。
建議患者根據自身情況選擇合適的治療方法，術後要注意保持傷口清潔乾燥，防止繼發感染。另外，還要定期複查，以便於瞭解恢復情況。
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