臨床上治療小兒過敏性鼻炎的藥物較多，主要包括抗組織胺藥、類固醇、白三烯感受器拮抗劑等。建議家長在醫生指導下根據具體情況給小兒選擇合適的藥物進行針對性治療。
抗組織胺藥
1.氯菲安明（Chlorpheniramine）：為第一代抗組織胺藥，具有中樞抑制作用，可以緩解鼻癢、噴嚏和流鼻涕等症狀，但不能減輕鼻塞症狀。
2.勝克敏（Cetirizine）：為第三代抗組織胺藥，副作用較小，對組織親和力高，幾乎完全不被吸收入血，在體內也不代謝失活，無鎮靜及嗜睡的作用，可明顯減少兒童夜間因鼻癢而頻繁喚醒。
3.依巴斯汀(Ebastine)：是一種高效低毒的第二代抗組織胺藥，不良反應少且輕，偶有乏力、睏倦、頭痛、思睡、噁心或胃腸不適等輕微不良反應。
4.氯雷他定(Loratadine)：屬於第三代抗組織胺藥，口服吸收迅速而完全，可用於治療過敏性鼻炎導致的鼻癢、打噴嚏和流水樣鼻涕等症狀。
類固醇
1.布地奈德（Budesonide）混懸液：透過霧化吸入到鼻腔內區域性應用，起效快，持續時間長，是目前治療變應性鼻炎最有效的藥物之一，適用於下鼻甲變性的患者。
2.Mometasone furoate鼻噴劑：主要成分為莫美他松糠酸酯(Mometasone furoate)，該藥可透過降低鼻黏膜炎症介質的釋放，達到舒緩鼻充血、瘙癢、流涕的效果。
白三烯感受器拮抗劑
欣流(Montelukast)咀嚼片為非處方藥，主要用於預防和治療運動誘發氣喘以及由過敏原引起的支氣管氣喘急性發作。另外，對於慢性蕁麻疹、過敏性鼻炎也有較好的療效。
其他
部分中成藥也可用於輔助治療小兒過敏性鼻炎，如通竅鼻炎膠囊、鼻淵舒口服液等，具有清熱解毒、宣肺通竅的功效，幫助改善鼻塞、流涕的症狀。
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