鼻竇炎和過敏性鼻炎均屬於比較常見的疾病，在治療方面需要根據具體症狀進行分析。鼻竇炎患者通常以藥物治療為主，如抗組織胺藥、類固醇等，而過敏性鼻炎的患者則可以使用抗組織胺藥、類固醇以及白三烯感受器拮抗劑等。
鼻竇炎
抗感染藥物
對於細菌引起的急性鼻竇炎，可遵醫囑服用希復欣敏(Cefixime)膠囊、阿莫西林（Amoxicillin）等抗生素控制發炎反應。如果是真菌引起，則需應用氟康唑(Fluconazole)等抗真菌藥物來改善病情。
減充血劑
常用滴鼻淨或麻黃素滴鼻液，透過收縮區域性微血管起到減輕水腫的作用，從而緩解鼻塞的症狀，但不能長期使用。
黏液溶解劑
常用的有生理食鹽水、高滲海水或布地奈德（Budesonide）吸入氣霧劑等，能夠幫助稀釋分泌物並促進排出，還可以減少分泌物對上氣道的刺激，從而減輕鼻腔不適感。
中成藥
比如通竅鼻炎顆粒、香菊膠囊等，具有散風清熱、宣通鼻竅的功效，可以幫助緩解鼻竇炎的相關症狀。
其他藥物
部分中藥方劑也可以用於輔助治療鼻竇炎，如蒼耳子鼻炎滴丸、藿膽滴丸等，也幫助消除發炎，改善相關症狀。
過敏性鼻炎
抗組織胺藥
主要有氯菲安明（Chlorpheniramine）、左西替利嗪(Levocetirizine)等，能對抗組織胺引發的過敏反應，降低身體致敏狀態，進而緩解鼻癢、打噴嚏等症狀。
類固醇
主要有貝克每松（Beclomethasone dipropionate）、Mometasone furoate鼻噴劑等，由於這類藥物作用持久，不良反應相對較少，因此是治療鼻竇炎較為理想的藥物。
白三烯感受器拮抗劑
主要為欣流(Montelukast)製劑，可用於輕至中度氣喘患者的常年性變應性鼻炎的維持治療，也可用於成人慢性蕁麻疹的額外治療。
此外，如果鼻竇炎合併過敏性鼻炎的情況較嚴重，上述單一用藥效果不佳時，可在醫生指導下聯合用藥，如口服加外用等。平時還要注意加強鍛煉，提高自身的免疫能力，並避免接觸花粉、動物皮屑等易誘發過敏的物質。
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