如果意外妊娠時孕囊比較小，比如直徑在1cm以下，並且孕婦沒有陰道大量流血、腹痛等先兆流產的症狀，則可以選擇藥物流產。而多數女性選擇人工流產終止妊娠的時間是在孕6-14周。
藥物流產
如果女性的停經時間在7周內，並且經過超音波檢查後發現孕囊並不是特別大，在這種情況下可以在醫生指導下口服藥物進行流產，常用的藥物有RU-486和米索前列醇(Misoprostol)。此類藥物需要遵醫囑服用，避免自行用藥導致不良後果。
人工流產
孕早期
如果平時月經周期規律，一般平均28天左右排卵，當發生性生活後7周左右可出現孕囊，此時孕囊較小，未出現在宮腔大部位置，可在門診採用負壓吸引術的方式進行處理，即將含有胚胎組織的管子從子宮頸進入子宮，利用負壓將胚胎吸出。
孕中期
若平時月經周期不規律或延後，則可能排卵推遲，孕囊出現得也晚，到孕60天左右才能看到孕囊。若在此期間患者無陰道大量流血、劇烈陣發性腹痛等情況，通常會選擇人工流產的方法來結束妊娠，方法包括擴張刮搔術以及羊膜腔外注射引產術兩種。其中擴張刮搔術是用專門的器械夾取胎兒及其附屬物，而羊水栓塞主要是向羊膜腔內注射藥物誘發子宮收縮，進而排出胎兒及其附屬物。
孕晚期
若平時月經周期不規律，那麼孕囊出現得更遲，但孕9個月之內均屬於孕晚期，此時期已不能做人流，只能透過生產的方式來處理，即為自然產或剖腹產。
其他情況
對於哺乳期過後的女性來說，再次生育的時間會有所延遲，因為哺乳對卵巢功能有一定的抑制作用。因此，再次意外妊娠時孕囊可能會比較大，甚至超過14周，此時則建議直接做人工流產或者行中期引產術。
需要注意的是，無論何時進行人工流產，都需要前往大醫院的婦科就診並完善血常規檢查、HCG檢測、凝血功能檢查等相關檢驗專案，以確保手術順利進行。此外，術後需注意保持區域性清潔衛生，以免引起感染的情況。
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