肺結核患者在遵醫囑使用利福平(Rifampin)、異煙肼(Isoniazid)等抗結核藥物進行治療時，通常不會出現明顯的不良反應和副作用。但部分患者可能會對肝臟功能造成損害，並且還可能傷害神經系統，嚴重者甚至可導致癲癇發作。
肝腎功能受損
由於利福平(Rifampin)的主要成分是利福黴素類的半合成廣譜抗菌藥，而異煙肼(Isoniazid)則具有一定的肝毒性，在長期服用上述兩種藥物的情況下，則有可能會對患者的肝腎功能造成影響，引起轉氨酶升高以及黃疸等情況發生。因此建議此類患者需要定期到醫院做肝功能檢查，以便於及時發現病情變化並採取針對性處理措施。如果出現了嚴重的肝功能異常情況，則應立即停用相關抗結核藥物，必要時還需考慮給予保肝護腎及促排膽酸等藥物改善症狀，如復方甘草酸苷片、普賴鬆(Prednisone)等。
神經傷害
若患者長時間或大劑量應用硫酸鏈黴素(Streptomycin Sulfate)、注射用鹽酸愛黴素(Amikacin)等氨基糖苷類抗生素，就可能導致出現不可逆性聽力損失，嚴重者還可誘發耳聾的情況發生。此外，對於本身患有神經疾病或者存在高敏體質的患者而言，也容易增加患上周圍神經炎、吉蘭-巴雷症候群等疾病的機率。故而對於這些易感人群來說，需避免濫用這類具有潛在神經毒性的抗結核藥物。
癲癇發作
若患者未按照醫生指導足療程、規律地吃抗結核藥物，就可能出現耐藥菌株繁殖的現象，從而進一步誘導病毒活躍複製，致使身體受到嚴重侵害，最終誘發癲癇發作的情況發生。此時不僅會危及生命健康，還會給後續治療帶來較大困難。所以一旦確診為肺結核後，就需要積極按醫囑堅持全程、規律服藥，以儘早治癒疾病。
其他
還有少數患者在服用吡嗪醯胺片等藥物期間，會出現噁心、嘔吐、腹瀉等症狀，一般無需特殊處理，待停止用藥後即可自行恢復。另外，也有少部分患者在服用利福平(Rifampin)後，會導致皮膚出現不同程度的發紅、瘙癢、皮疹等不適現象，對此也無須過於擔心，停藥後大多也可逐漸消退。
綜上所述，雖然肺結核屬於一種可以被有效控制的慢性呼吸系統傳染病，但由於其病程較長，所以在患病之後一定要嚴格遵循醫生制定的方案來執行，切忌擅自增減藥量或延長用藥時間，以免耽誤病情。
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