如果存在包皮過長的情況，並且影響到陰莖的發育或者容易造成感染等，需要及時進行處理。對於嬰幼兒時期的患者來說，一般會隨著年齡增長而自行恢復，通常不需要特殊治療。但對於成年男性來說，則建議行手術治療。
一、非藥物治療
清洗
每天用清水沖洗包皮和冠狀溝，以保持區域性清潔衛生。如果有滲出物或紅腫等情況時，可以用硼酸溶液溼敷，再用優點消毒液塗擦患處。
手法復位
如果是新生兒出現包皮過長的現象，在平時可以將包皮用手向後推擠，然後露出龜頭。這種方法比較適合生理性包莖，但是要注意力度適中，避免傷害龜頭。
工具擴張
當包皮口狹窄嚴重，導致反覆發炎時，可使用專門設計的小器械撐開包皮口，讓陰莖頭露出來。但這種方法可能會引起疼痛不適感以及出血症狀，因此不作為首選方法。
其他方式
部分人群在青春期之後由於陰莖勃起，會導致包皮自然回縮，從而顯露陰莖頭，此時則無需做過多干預。而對於成年人來說，若無明顯臨床症狀，也無需進行特殊治療。
二、藥物治療
對於併發包皮及龜頭輕度發炎者，可遵醫囑外用過錳酸鉀(KMnO4)稀釋液浸泡，隨後塗抹抗生素軟膏，如膚利舒軟膏(Mupirocin)等。若繼發細菌性感染，則需口服抗菌藥治療，例如阿奇黴素(Azithromycin)、左氧氟沙星（Levofloxacin）膠囊等。
三、手術治療
臨床上常用的術式是包皮環切術，即切除陰莖上多餘的包皮組織，使陰莖頭充分外露。該術式簡單易行，術後效果好，複發率低，目前應用較為廣泛。此外，也可選擇雷射包皮環切術，其具有對血管和淋巴管傷害小、術後疤痕組織形成少等特點。
四、其它治療
除上述治療方法之外，還包括注射劑療法、套環法等。其中注射劑療法是指將肥皂水、過錳酸鉀(KMnO4)溶液等注入陰莖頭囊腔內，破壞伸於陰莖頭表面的包皮粘連，使其鬆懈。而後醫生再把包皮翻轉，暴露陰莖頭，為以後定期清洗創造條件。而套環法則是在麻醉下，將兩根膠管分別套於陰莖繫帶兩側，然後用尼龍線貫穿其間，打結收緊即可。此法操作簡便，療效可靠，但應注意預防感染。
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