如果出現牙肉包住智齒的情況，則需要根據導致該現象的原因進行處理。如果是萌出性腫脹引起的現象，則可以暫時觀察、藥物治療或切開排膿等方法緩解症狀。但多數情況下是由於齲病、根尖周炎、智齒冠周炎等原因所致，此時則應遵醫囑選擇合適的治療方法。
一、齲病
若患者牙齒發生齲壞而形成齲洞時，隨著病情發展可逐漸增大加深，並刺激周圍組織發炎，從而表現為上述情況。對此可在醫生指導下使用氟化亞錫、氟化銨等含氟製劑預防琺瑯質再礦化，也可採用窩溝封閉的方法減少食物殘渣的滯留。另外還可應用氫氧化鈣或復合樹脂等材料進行修補治療。
二、根尖周炎
急性期
對於急性根尖周炎早期的患者而言，在發炎發作期間主要以消炎去痛為主，如口服阿斯匹靈（Aspirin）、乙醯胺酚（Acetaminophen）等非類固醇抗發炎藥幫助減輕疼痛。同時還需要配合靜脈注射頭孢曲松(Ceftriaxone)、甲硝唑(Metronidazole)等抗生素類藥物控制感染。待發炎得到控制後，即可透過根管治療術的方式清除患牙根管內以及髓腔內的壞死組織和細菌，並進行根管充填，防止再次感染。
慢性期
而對於慢性根尖周炎的患者來說，通常會伴有瘻管、竇道等症狀。若長期不接受治療可能會導致鄰近牙齒發生齲壞，進而影響正常咀嚼功能。因此此類患者也需要積極配合醫生進行根管治療，將根管內以及髓腔內的感染物質徹底清理乾淨，並嚴密填充根管。必要時還需進行樁冠修復或者拔除患牙。
三、智齒冠周炎
當存在智齒冠周炎時也會導致以上表現，還會伴隨明顯的腫脹及吞咽困難等情況。針對這種情況，建議在急性期給予足量且有效的抗菌素進行抗感染治療，比如盤尼西林、紅黴素(Erythromycin)等。若已經形成膿腫，則需及時切開引流並定期換藥促進癒合。而對於反覆發生的智齒冠周炎，則可以在發炎控制後考慮直接拔除智齒。
此外，若是口腔腫瘤所引起，還應及時採取手術切除腫瘤組織並輔以化療等方式輔助治療。日常生活中還要注意保持良好的飲食習慣，避免進食辛辣刺激性的食物，以免加重不適症狀。
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