臨床上治療甲狀腺功能亢進症的藥物很多，具體哪種藥物更好需要根據患者的病情而定。常用的口服藥物有咪唑類化合物、硫氧嘧啶類化合物等，注射用藥主要有複合碘溶液、甲基硫氧嘧啶等。
口服藥物
咪唑類化合物
主要包括僕樂彼錠(Propylthiouracil)和甲硫嗎唑(Methimazole)兩種。其中僕樂彼錠(Propylthiouracil)對心血管系統的影響相對較小，而且能透過抑制甲狀腺過氧化物酶，阻斷核蛋白合成而發揮抗甲狀腺的作用；甲硫嗎唑(Methimazole)是一種咪唑衍生物，可以抑制甲狀腺內的過氧化物酶，使自身合成甲狀腺素受阻，從而達到減少甲狀腺素生成的目的。這兩種藥物都有良好的療效，但要注意的是服用期間可能會出現白血球下降的情況，因此要定期複查血常規。
硫氧嘧啶類化合物
包括甲硫氧嘧啶以及硫脲。甲硫氧嘧啶是咪唑類衍生物，在體內被氧化成亞碸和氫離子，再分解為二氧化碳和水，同時釋放出二氧化硫氣體，從而起到殺菌作用。硫脲則能夠抑制甲狀腺內過氧化物酶，阻止酪氨酸轉化為甲狀腺素，進而降低甲狀腺素水平。但由於硫脲容易與其他一些含鐵或鈣的製劑發生相互反應，所以患者在使用時需要注意避免與這些物質同服。
注射用藥
複合碘溶液
可用於甲狀腺次全切除術前的準備及甲狀腺危象的緊急處理，其主要成分是分子碘和生理食鹽水，可透過與組織中碘競爭而抑制甲狀腺素的合成，並可促進甲狀腺上皮細胞凋亡，以達到治療目的。
甲基硫氧嘧啶
本品屬於硫脲衍生物，進入人體後迅速解離成自由基，然後與甲狀腺內的T3、T4結合形成無活性的複合物，從而使甲狀腺素無法發揮作用，最終達到控制甲狀腺素分泌的效果。
除了上述常見幾種藥物外，還存在其他可能有利的食物，比如夏枯草代餐減肥法，用夏枯草泡茶喝，每天堅持喝，有助於調節內分泌，改善甲狀腺問題。建議患者不要盲目自行用藥，必要時可就醫遵醫囑用藥治療。日常生活中應保持情緒穩定，注意休息，清淡飲食，幫助疾病恢復。
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